A eliminação de sangue e de restos do endométrio pela vagina é a menstruação. Ela dura de 3 a sete dias. O período entre o início de uma menstruação e o início da seguinte é chamado de ciclo menstrual.

Um novo ciclo menstrual tem início com a retomada da produção de FSH. O aumento da taxa sanguínea de FSH induz o desenvolvimento do folículo ovariano, que passa a produzir estrógeno, elevando a taxa desse hormônio no sangue.

O estrógeno estimula o desenvolvimento do endométrio, que se torna rico em vasos sanguíneos e em glândulas. Quando a taxa sanguínea de estrógeno atinge determinado nível, a hipófise é estimulada a liberar grandes quantidades de FSH e de LH.

A ação conjunta desses hormônios induz a ovulação. A taxa elevada de LH induz as células do folículo ovariano rompido a se transformarem no corpo-amarelo, que produz estrógeno em pequena quantidade e progesterona em quantidade elevada. Estrógeno e progesterona atuam em conjunto sobre o útero, que dá continuidade a preparação para uma eventual gravidez. A alta desses dois hormônios, entretanto, passa a exercer efeito inibidor sobre a produção de FSH e LH.

Como conseqüência o corpo-amarelo regride, parando de produzir estrógeno e progesterona. Isso faz com que a mucosa uterina sofra descamação, ocorrendo a menstruação. Além disso, com a queda da produção desses dois hormônios, a hipófise volta a produzir FSH, reiniciando o ciclo menstrual.